Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD8P48556 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms