Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms