Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP5P45974 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP5P45974 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP5P45974 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP5P45974 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP5P45974 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP5P45974 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP5P45974 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP5P45974 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP5P45974 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP5P45974 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms