Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms