Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFBP38117 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms