Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP62P37198 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP62P37198 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP62P37198 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP62P37198 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP62P37198 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP62P37198 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP62P37198 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP62P37198 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP62P37198 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP62P37198 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP62P37198 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP62P37198 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP62P37198 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP62P37198 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP62P37198 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP62P37198 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP62P37198 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP62P37198 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP62P37198 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP62P37198 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP62P37198 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP62P37198 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP62P37198 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms