Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms