Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA1P35221 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms