Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms