Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms