Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID4AP29374 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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