Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms