Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms