Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CXCL3P19876 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CXCL3P19876 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CXCL3P19876 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CXCL3P19876 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CXCL3P19876 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CXCL3P19876 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CXCL3P19876 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CXCL3P19876 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CXCL3P19876 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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