Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF1P18846 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF1P18846 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF1P18846 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF1P18846 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF1P18846 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms