Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms