Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREB1P16220 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREB1P16220 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB1P16220 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB1P16220 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms