Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms