Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CETPP11597 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CETPP11597 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CETPP11597 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CETPP11597 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CETPP11597 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CETPP11597 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CETPP11597 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CETPP11597 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CETPP11597 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CETPP11597 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CETPP11597 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CETPP11597 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CETPP11597 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CETPP11597 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CETPP11597 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CETPP11597 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CETPP11597 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CETPP11597 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CETPP11597 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CETPP11597 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CETPP11597 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CETPP11597 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CETPP11597 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CETPP11597 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms