Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms