Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM200BP0CF97 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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FAM200BP0CF97 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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