Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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