Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFLP07196 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEFLP07196 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEFLP07196 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEFLP07196 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEFLP07196 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms