Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms