Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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