Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms