Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms