Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCA5O60264 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms