Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms