Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms