Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
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