Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms