Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms