Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF1O43189 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF1O43189 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms