Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNJ2O15056 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms