Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APAF1O14727 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APAF1O14727 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APAF1O14727 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APAF1O14727 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms