Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms