Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DXG7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4DXG7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4DXG7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4DXG7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4DXG7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4DXG7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms