Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms