Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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