Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms