Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms