Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TARSL2A2RTX5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TARSL2A2RTX5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms