Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms