Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms