Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MED16Q9Y2X0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms