Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBNO2Q9Y2G9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms