Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms