Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms