Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFSF18Q9UNG2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms